RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 PAMP19021 973 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ITIH1P19827 911 aa22.7■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 ETV5P41161 510 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 PAFAH1B1P43034 410 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 MC2RQ01718 297 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 PPP1R7Q15435 360 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM164Q5U3C3 297 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 PDZD3Q86UT5 571 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ACVR1CQ8NER5 493 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ZPBPQ9BS86 351 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 PISDQ9UG56 409 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 SDK2Q58EX2 2172 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 C9orf172C9J069 976 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 USP1O94782 785 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 VAPBO95292 243 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 POLBP06746 335 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 CCL4P13236 92 aa22.69■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 TLE3Q04726 772 aa22.69■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 DTX1Q86Y01 620 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 SPACA3Q8IXA5 215 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 RSC1A1Q92681 617 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ITPR1Q14643 2758 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 OR5K3A6NET4 321 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 MATN2O00339 956 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 KPNA5O15131 536 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 PFDN6O15212 129 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 SLCO2B1O94956 709 aa22.68■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 KCNE4Q8WWG9 221 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.68■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 CDYLQ9Y232 598 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa22.67■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 MORF4L2Q15014 288 aa22.67■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.67■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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CTDSP2-203ENST00000547701 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 H3BMM5 538 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 NDUFS3O75489 264 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 TTC4O95801 387 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ESR1P03372 595 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CTDSP2-203ENST00000547701 DR1Q01658 176 aa22.65■■□□□ 1.22
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