RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	GABRE	P78334	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CRADD	P78560	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61	4e-7	■■■□□ 16.4
MDM2-234	ENST00000546048	NFATC2	Q13469	925 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NR1D2	Q14995	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TGIF1	Q15583	401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CCNG2	Q16589	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CARD9	Q9H257	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	VPS18	Q9P253	973 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	BPTF	Q12830	3046 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TNFSF15	O95150	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PNLIP	P16233	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TYRP1	P17643	537 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PDHA2	P29803	388 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	FOXN2	P32314	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	LSS	P48449	732 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CLCNKA	P51800	687 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	GFER	P55789	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	P3H1	Q32P28	736 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	NAT6	Q93015	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-234	ENST00000546048	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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