RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TGFBI	Q15582	683 aa		15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	REP15	Q6BDI9	236 aa		15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	CHSY3	Q70JA7	882 aa		15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		15.44	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SNX2	O60749	519 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TIPRL	O75663	272 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	C1S	P09871	688 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SHH	Q15465	462 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	MACC1	Q6ZN28	852 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	C12orf40	Q86WS4	652 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	MTG2	Q9H4K7	406 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	CD274	Q9NZQ7	290 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	CAPNS1	P04632	268 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SPINT3	P49223	89 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	FOXA1	P55317	472 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	NME5	P56597	212 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ARSI	Q5FYB1	569 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	KRT80	Q6KB66	452 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	GAB3	Q8WWW8	586 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	C19orf60	Q96EN9	201 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		15.43	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A1B0GTL3	188 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF839	A8K0R7	811 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	AZIN1	O14977	448 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ADH1C	P00326	375 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	PBX2	P40425	430 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	RHD	Q02161	417 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	LRP8	Q14114	963 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	DUSP6	Q16828	381 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF597	Q96LX8	424 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	C3orf30	Q96M34	536 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ABCG8	Q9H221	673 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	PCTP	Q9UKL6	214 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0J9YVX5	310 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	UBD	O15205	165 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	MAGEB3	O15480	346 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	NSG1	P42857	185 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	KANK2	Q63ZY3	851 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ESAM	Q96AP7	390 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNA7	Q96RP8	456 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193		C9JVG2	144 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TULP3	O75386	442 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	GPC4	O75487	556 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	H6PD	O95479	791 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	C8B	P07358	591 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	CTSL	P07711	333 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	RGS4	P49798	205 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	NAA20	P61599	178 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TMED1	Q13445	227 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ARHGEF7	Q14155	803 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SBSN	Q6UWP8	590 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ZBTB2	Q8N680	514 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ASB16	Q96NS5	453 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	COPS8	Q99627	209 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	OLAH	Q9NV23	265 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	CD84	Q9UIB8	345 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	TRANK1	O15050	2925 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	MRAS	O14807	208 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	DGKA	P23743	735 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC7A2	P52569	658 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	STX5	Q13190	355 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	CARM1	Q86X55	608 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF366	Q8N895	744 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	LRCH3	Q96II8	777 aa		15.41	■□□□□ 0.06
GRSF1-208	ENST00000545193	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		15.41	■□□□□ 0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms