RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	KCTD16	Q68DU8	428 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	LCA5	Q86VQ0	697 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	MZB1	Q8WU39	189 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	C12orf66	Q96MD2	445 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	GAREM1	Q9H706	876 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	CAPN10	Q9HC96	672 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KDM1A	O60341	852 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	GPC4	O75487	556 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KLHL2	O95198	593 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	GSTA1	P08263	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ALPPL2	P10696	532 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ENG	P17813	658 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CYP2A7	P20853	494 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CCNF	P41002	786 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	NBL1	P41271	181 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PGGT1B	P53609	377 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	IRF9	Q00978	393 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	IL9R	Q01113	521 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	HLA-B	Q31612	363 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PPM1J	Q5JR12	505 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC63	Q8NA47	563 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MED4	Q9NPJ6	270 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KLF15	Q9UIH9	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MID2	Q9UJV3	735 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658		B4DGG1	531 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	BTN3A1	O00481	513 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	C8G	P07360	202 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	RBP1	P09455	135 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	F3	P13726	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	BRAF	P15056	766 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TFEB	P19484	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	HIST1H2AD	P20671	130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PDHA2	P29803	388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	RXRG	P48443	463 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ABR	Q12979	859 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SP140	Q13342	867 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	GBX1	Q14549	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ACAP2	Q15057	778 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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