RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 SSX6Q7RTT6 188 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MILR1Q7Z6M3 343 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.12□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 NUDT11Q96G61 164 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ACOX2Q99424 681 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 HERV-K104P61576 105 aa3.11□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TIMM10P62072 90 aa3.11□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ARL6IP1Q15041 203 aa3.11□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.917e-7■■□□□ 14
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JMJD1C-210ENST00000542921 DCAF6Q58WW2 860 aa3.11□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.11□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC27A3Q5K4L6 730 aa3.11□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.11□□□□□ -1.91
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JMJD1C-210ENST00000542921 REP15Q6BDI9 236 aa3.11□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC22A25Q6T423 547 aa3.11□□□□□ -1.91
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