RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528145.5

ATG13-210, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-210ENST00000528145 TMED2Q15363 201 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 KYNUQ16719 465 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 DHRS13Q6UX07 377 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SPRED1Q7Z699 444 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SLC26A11Q86WA9 606 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 VRK3Q8IV63 474 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 TRIM48Q8IWZ4 208 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 AVL9Q8NBF6 648 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 GIMAP7Q8NHV1 300 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 FBF1Q8TES7 1133 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 KCNJ9Q92806 393 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 TMEM159Q96B96 161 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CXorf40BQ96DE9 158 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CCDC68Q9H2F9 335 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 GALPQ9UBC7 116 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 PTPRBP23467 1997 aa13.06□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 E5RI56 91 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 OPA1O60313 960 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ACSL3O95573 720 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 VIPP01282 170 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 FAM153BP0C7A2 387 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CHRM3P20309 590 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CLCN7P51798 805 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 GBX1Q14549 363 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 FAM153CQ494X1 144 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CYS1Q717R9 158 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 OTOAQ7RTW8 1153 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 STRA8Q7Z7C7 330 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 PIM3Q86V86 326 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SLC22A15Q8IZD6 547 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ZBTB2Q8N680 514 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ASZ1Q8WWH4 475 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CDKL2Q92772 493 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SLC30A3Q99726 388 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SLC40A1Q9NP59 571 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 COMMD10Q9Y6G5 202 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 V9GYY5 206 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 UNC13CQ8NB66 2214 aa13.05□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 A0A1W2PQM1 296 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 LILRA5A6NI73 299 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 KPNA5O15131 536 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SLCO2B1O94956 709 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ACADLP28330 430 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ALDH4A1P30038 563 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 GPR3P46089 330 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CDKN2DP55273 166 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 OR1D5P58170 312 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CCL7P80098 99 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 GPR18Q14330 331 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 TMEM26Q6ZUK4 368 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CTAGE3PQ8IX95 158 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 GPATCH11Q8N954 259 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CD200R1Q8TD46 325 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SLC38A3Q99624 504 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 GPR21Q99679 349 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 TXLNGYQ9BZA5 131 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 UCK1Q9HA47 277 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 LATS2Q9NRM7 1088 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 B4GAT1O43505 415 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 VPS26AO75436 327 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CDK4P11802 303 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 ATP5DP30049 168 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 CSF2RBP32927 897 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 PHBP35232 272 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 EPHA4P54764 986 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 VSNL1P62760 191 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 TUBB4BP68371 445 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 E2F1Q01094 437 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 FOXC1Q12948 553 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 NAB1Q13506 487 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 SLMAPQ14BN4 828 aa13.03□□□□□ -0.32
ATG13-210ENST00000528145 AMZ1Q400G9 498 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms