RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516209.1

RNU2-30P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 30, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-30P, Length 141 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-30P-201ENST00000516209 DEC1Q9P2X7 70 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 RNF7Q9UBF6 113 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 R4GN57 208 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 FANCMQ8IYD8 2048 aa4.9□□□□□ -1.62
RNU2-30P-201ENST00000516209 A0A087X0T9 212 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 M0QYG6 137 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SGK1O00141 431 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CNTN5O94779 1100 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 AHSGP02765 367 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SERPING1P05155 500 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CISD3P0C7P0 127 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 FAM228BP0C875 321 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 KRT3P12035 628 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 HOXB2P14652 356 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 HLA-FP30511 346 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CCR1P32246 355 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 RDXP35241 583 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 GJC1P36383 396 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 MAGEA9P43362 315 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CXCR3P49682 368 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 ZNF81P51508 661 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CCR3P51677 355 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 OGDHQ02218 1023 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 LMAN2Q12907 356 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CDH18Q13634 790 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 LPAL2Q16609 132 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CCDC14Q49A88 953 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 MPPE1Q53F39 396 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 ANO7Q6IWH7 933 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 FBXL22Q6P050 247 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 WDR59Q6PJI9 974 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SARM1Q6SZW1 724 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 BEND5Q7L4P6 421 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 OR8H2Q8N162 312 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SPEM1Q8N4L4 309 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TEX9Q8N6V9 391 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CCDC185Q8N715 623 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 FAM172AQ8WUF8 416 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 DDB2Q92466 427 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 IGSF8Q969P0 613 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 EXOC4Q96A65 974 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 REPS1Q96D71 796 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 IQCDQ96DY2 449 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 ZNF778Q96MU6 729 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 AGAP3Q96P47 875 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 EDEM3Q9BZQ6 932 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 THAP2Q9H0W7 228 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 GGA2Q9UJY4 613 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 CKAP5Q14008 2032 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 A0A1B0GVM2 712 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 WASH3PC4AMC7 463 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 E9PAM4 449 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 FAM72CH0Y354 149 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 H0Y626 953 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 PPM1DO15297 605 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 SRGAP2O75044 1071 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 RTN2O75298 545 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 DNAJB5O75953 348 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 JTBO76095 146 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU2-30P-201ENST00000516209 IL33O95760 270 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms