RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 OR7A10O76100 309 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SCNN1AP37088 669 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CDH13P55290 713 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CLCA4Q14CN2 919 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LDHDQ86WU2 507 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 P3H2Q8IVL5 708 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CARFQ8N187 725 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 NUAK2Q9H093 628 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 A0A0G2JPF8 293 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TPST1O60507 370 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 XYLBO75191 536 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RBP1P09455 135 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SPNP16150 400 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CHMP24386 653 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SLC12A2P55011 1212 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SNAP25P60880 206 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RAB10P61026 200 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CHRNB3Q05901 458 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 KEAP1Q14145 624 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PPA1Q15181 289 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ZPBP2Q6X784 338 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 KCNMB4Q86W47 210 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TMBIM1Q969X1 311 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 GPR78Q96P69 363 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM245Q9H330 911 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 STRCQ7RTU9 1775 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CARNS1A5YM72 827 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 B4GAT1O43505 415 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 WDPCPO95876 746 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 APOC1P02654 83 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 FGF4P08620 206 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HSD3B2P26439 372 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HNF4AP41235 474 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 IL12RB1P42701 662 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TM4SF4P48230 202 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HSPA2P54652 639 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 UBE3AQ05086 875 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TNK1Q13470 666 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ITPK1Q13572 414 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TEX30Q5JUR7 227 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CNSTQ6PJW8 725 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RNF180Q86T96 592 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CUZD1Q86UP6 607 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PIGZQ86VD9 579 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TTLL6Q8N841 843 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LPAR1Q92633 364 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 MBOAT4Q96T53 435 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 BCO2Q9BYV7 579 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 COA4Q9NYJ1 87 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms