RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 AGAP14A8MT82 685 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 B8ZZF3 427 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 EFSO43281 561 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UGT1A9O60656 530 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFS3O75489 264 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 NUDT17P0C025 328 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UGT1A6P19224 532 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UGT1A1P22309 533 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UGT1A4P22310 534 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 FOXN2P32314 431 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UGT1A3P35503 534 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM23P36406 574 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 MSH2P43246 934 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 MAPK10P53779 464 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 BIRC2Q13490 618 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 AMZ1Q400G9 498 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF470Q6ECI4 717 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 USP53Q70EK8 1073 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 CROCCP2Q86T23 111 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 CILP2Q8IUL8 1156 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 CNTN4Q8IWV2 1026 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UNC5BQ8IZJ1 945 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 PPM1NQ8N819 430 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 GDAP1Q8TB36 358 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD7Q92527 254 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 VPS35Q96QK1 796 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 CMKLR1Q99788 373 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 CPNE1Q99829 537 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UGT1A7Q9HAW7 530 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UGT1A10Q9HAW8 530 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 UGT1A8Q9HAW9 530 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 RDH14Q9HBH5 336 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 SMOXQ9NWM0 555 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 FETUBQ9UGM5 382 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO5Q9UKT4 447 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 PLAAQ9Y263 795 aa11.15□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CFAP99D6REC4 459 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 F8W8V4 182 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PRAMEF10O60809 474 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 INHBAP08476 426 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LIPCP11150 499 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RALBP11234 206 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PNLIPP16233 465 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ALDH4A1P30038 563 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ETV5P41161 510 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 20.7
UBE2B-208ENST00000511807 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CTBP1Q13363 440 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 DSG2Q14126 1118 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ITIH4Q14624 930 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 CASP8Q14790 479 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GRTP1Q5TC63 336 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LGSNQ5TDP6 509 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GALNT7Q86SF2 657 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINA9Q86WD7 417 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 ZFAND4Q86XD8 727 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 IQCKQ8N0W5 287 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 NXPE1Q8N323 547 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 USP7Q93009 1102 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 GLYATL1Q969I3 302 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 RUFY1Q96T51 708 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 AGAP2Q99490 1192 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 COPS8Q99627 209 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 FAM96AQ9H5X1 160 aa11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
UBE2B-208ENST00000511807 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms