RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511392.5

CDV3-208, Transcript of CDV3 homolog, human

TSL 5 BASIC

Gene CDV3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDV3-208	ENST00000511392	TJP3	O95049	919 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SOD1	P00441	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TRBC1	P01850	177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SERPINF2	P08697	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RBP3	P10745	1247 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	C6	P13671	934 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF28	P17035	718 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ENG	P17813	658 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RBL1	P28749	1068 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CXCR5	P32302	372 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NUDT1	P36639	197 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CD86	P42081	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DPP6	P42658	865 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	LIMK1	P53667	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NXPH1	P58417	271 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	IRX4	P78413	519 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	BCL2L1	Q07817	233 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GRM3	Q14832	879 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ACAP2	Q15057	778 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	IRF4	Q15306	451 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SHB	Q15464	509 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SLC35F6	Q8N357	371 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SNX19	Q92543	992 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	P3H4	Q92791	437 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KLK6	Q92876	244 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	EID2B	Q96D98	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	WDR24	Q96S15	920 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	LYSMD1	Q96S90	227 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MYOC	Q99972	504 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	GBA3	Q9H227	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	SPTBN2	O15020	2390 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392		A0A1W2PQ67	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	POM121B	A6NF01	834 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CDV3-208	ENST00000511392		H7C0C1	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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