RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	GTF2H3	Q13889	308 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	NFE2L1	Q14494	772 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC9A5	Q14940	896 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	RAD18	Q9NS91	495 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		12.82	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ACAN	P16112	2415 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM221A	A4D161	298 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	CLDN14	O95500	239 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC4A1	P02730	911 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	PIRT	P0C851	137 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SERPINB6	P35237	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	KLK7	P49862	253 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SYCP1	Q15431	976 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	NFKBIB	Q15653	356 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	DPYSL2	Q16555	572 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	GPR135	Q8IZ08	494 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	GDAP1	Q8TB36	358 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MAML1	Q92585	1016 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	C12orf66	Q96MD2	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	VPS35	Q96QK1	796 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	LHPP	Q9H008	270 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36	2e-6	■□□□□ 11.1
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	GSAP	A4D1B5	854 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	EPHB6	O15197	1021 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP3K7	O43318	606 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHL18	O94889	574 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	HLA-DPA1	P20036	260 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MMP11	P24347	488 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF165	P49910	485 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SMS	P52788	366 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MFAP5	Q13361	173 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	NACC2	Q96BF6	587 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	TTC25	Q96NG3	672 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM7	Q9C029	511 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	WWP1	Q9H0M0	922 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	PARVA	Q9NVD7	372 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276		H3BMH7	237 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MATN2	O00339	956 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SOCS6	O14544	535 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MATN3	O15232	486 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	HLA-DQB2	P05538	268 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MMP2	P08253	660 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP1A3	P13637	1013 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	PVR	P15151	417 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	MST1	P26927	711 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	IL1R2	P27930	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	CTSC	P53634	463 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	UBE2H	P62256	183 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	CSNK1G2	P78368	415 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	INA	Q16352	499 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	METRNL	Q641Q3	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	HSPH1	Q92598	858 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	LMF1	Q96S06	567 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	AGPAT1	Q99943	283 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	NDC1	Q9BTX1	674 aa		12.79	□□□□□ -0.36
FAM53C-208	ENST00000511276	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms