RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507692.5

SNHG4-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 5

Gene SNHG4, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-205	ENST00000507692	NDUFS1	P28331	727 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PTGIR	P43119	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CAPZB	P47756	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CD151	P48509	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MAPK10	P53779	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	DR1	Q01658	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CFHR1	Q03591	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KRT33B	Q14525	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SYTL3	Q4VX76	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KLHL35	Q6PF15	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	JAML	Q86YT9	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ELMO1	Q92556	727 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TCF12	Q99081	682 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PISD	Q9UG56	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692		A0A087WV48	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SMAP	O00193	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MATN2	O00339	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KPNA5	O15131	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FANCG	O15287	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TTI1	O43156	1089 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KDM1A	O60341	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RASSF9	O75901	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TTC4	O95801	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	C9	P02748	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	APOA4	P06727	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ITGB6	P18564	788 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ITIH1	P19827	911 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CD82	P27701	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PDHA2	P29803	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC5A2	P31639	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ETV5	P41161	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MAGEA3	P43357	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PREP	P48147	710 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	GFER	P55789	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RAB15	P59190	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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