RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 COPG2Q9UBF2 871 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0J9YY10 115 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ASPDHA6ND91 283 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SGTAO43765 313 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 AP2A1O95782 977 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ITGAXP20702 1163 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SLC1A1P43005 524 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ARL4DP49703 201 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-210ENST00000503258 CHAF1BQ13112 559 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ASIC2Q16515 512 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-210ENST00000503258 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 AGAP4Q96P64 663 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 RNF157Q96PX1 679 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 MAP3K3Q99759 626 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-210ENST00000503258 GLOD4Q9HC38 313 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 GSAPA4D1B5 854 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 A8MU76 341 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 EPHB6O15197 1021 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 UMODP07911 640 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 MYL5Q02045 173 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ATP1A4Q13733 1029 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.46□□□□□ -1.21
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PDE4D-210ENST00000503258 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 NTNG2Q96CW9 530 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TEKT5Q96M29 485 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 KNTC1P50748 2209 aa7.46□□□□□ -1.22
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PDE4D-210ENST00000503258 CDK14O94921 469 aa7.46□□□□□ -1.22
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PDE4D-210ENST00000503258 CYP2A7P20853 494 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 SMSP52788 366 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 ABRQ12979 859 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 DPCR1Q3MIW9 517 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 TEX44Q53QW1 395 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 SPESP1Q6UW49 350 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 SCMH1Q96GD3 660 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 ANO10Q9NW15 660 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.46□□□□□ -1.22
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PDE4D-210ENST00000503258 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.46□□□□□ -1.22
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PDE4D-210ENST00000503258 NR4A3Q92570 626 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-210ENST00000503258 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 DTLQ9NZJ0 730 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 FAM153AQ9UHL3 310 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 KALRNO60229 2985 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 PSMD3O43242 534 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 COX6B1P14854 86 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 IL10P22301 178 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 MPSTP25325 297 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-210ENST00000503258 ADRA1AP35348 466 aa7.45□□□□□ -1.22
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