RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC88CQ9P219 2028 aa22.58■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 KCNK1O00180 336 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 KCNJ13O60928 360 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 PIRTP0C851 137 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 BPIP17213 487 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 PTPN3P26045 913 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CASQ1P31415 396 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 HALP42357 657 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 PDE1BQ01064 536 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 WASHC5Q12768 1159 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB17Q13105 803 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 HPS6Q86YV9 775 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 D2HGDHQ8N465 521 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 Q8NA96 180 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 GPR150Q8NGU9 434 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CD180Q99467 661 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.57■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 A1L4Q6 167 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TLCD2A6NGC4 264 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 LIASO43766 372 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 DMPKQ09013 629 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 MAP3K3Q99759 626 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 POLEQ07864 2286 aa22.56■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 C5orf60A6NFR6 353 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 DPM1O60762 260 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SLC4A1P02730 911 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 RBL1P28749 1068 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 PTGIRP43119 386 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TUBB4BP68371 445 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 HSD11B2P80365 405 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 GPS2Q13227 327 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TUBB2AQ13885 445 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CYP1B1Q16678 543 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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SIMC1-208ENST00000495423 COG1Q8WTW3 980 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TADA1Q96BN2 335 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 LRFN5Q96NI6 719 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.55■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CASS4Q9NQ75 786 aa22.55■■□□□ 1.2
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SIMC1-208ENST00000495423 WIPF3A6NGB9 483 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SCRG1O75711 98 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 ARL4DP49703 201 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CDK18Q07002 472 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 GTF2H3Q13889 308 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 RPE65Q16518 533 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 C4orf22Q6V702 233 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 MR1Q95460 341 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SPATA13Q96N96 652 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 GLOD4Q9HC38 313 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 OR5K3A6NET4 321 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 KCNN4O15554 427 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 AMZ2Q86W34 360 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM126BQ8IUX1 230 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CARFQ8N187 725 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 PNPLA2Q96AD5 504 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 FCRL5Q96RD9 977 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 CHST8Q9H2A9 424 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 PCSK5Q92824 1860 aa22.53■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 FANCGO15287 622 aa22.52■■□□□ 1.2
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM63AO94886 807 aa22.52■■□□□ 1.2
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