RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PLAA	Q9Y263	795 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	RELN	P78509	3460 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CFAP99	D6REC4	459 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	LIAS	O43766	372 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	SPAG6	O75602	509 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	IFNB1	P01574	187 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	FGF5	P12034	268 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ETS1	P14921	441 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ACRV1	P26436	265 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PDHA2	P29803	388 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	DLST	P36957	453 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	GRIA1	P42261	906 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PREP	P48147	710 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	SNX1	Q13596	522 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	KRT33B	Q14525	404 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	P3H1	Q32P28	736 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	KLHL35	Q6PF15	583 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	UBXN4	Q92575	508 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540		H7C0S8	307 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ARL4D	P49703	201 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CACNG1	Q06432	222 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	MAP7	Q14244	749 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	IL11RA	Q14626	422 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	GPR19	Q15760	415 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	C4orf17	Q53FE4	359 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	BLACE	A4D250	179 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PSMD3	O43242	534 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	KATNA1	O75449	491 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	FURIN	P09958	794 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	TCN2	P20062	427 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	LMAN1	P49257	510 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PRKG2	Q13237	762 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	BRD3	Q15059	726 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ASIC3-208	ENST00000490540	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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