RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 METRNLQ641Q3 311 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PRELID2Q8N945 189 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 OR4K2Q8NGD2 314 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 OR13C4Q8NGS5 318 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ZNF398Q8TD17 642 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 C12orf66Q96MD2 445 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CARD6Q9BX69 1037 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 AP1M1Q9BXS5 423 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 TWSG1Q9GZX9 223 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 GBA3Q9H227 469 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 LHX9Q9NQ69 397 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SEMA5BQ9P283 1151 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 FKBPLQ9UIM3 349 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ANAPC2Q9UJX6 822 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PADI1Q9ULC6 663 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PLAAQ9Y263 795 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 NAV2Q8IVL1 2488 aa12.33□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SPTBP11277 2137 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PIPSLA2A3N6 862 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 OR6C74A6NCV1 312 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 HACD1B0YJ81 288 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CCL22O00626 93 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CREG1O75629 220 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 DNAJB5O75953 348 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PDGFAP04085 211 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 POLBP06746 335 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CCNYL3P0C7X3 344 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PSMB4P28070 264 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ADRA1AP35348 466 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 TMPRSS15P98073 1019 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 XRCC4Q13426 336 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ITGA9Q13797 1035 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SEPT6Q14141 434 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 GPR19Q15760 415 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 LRRN4CLQ8ND94 238 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 DTX3LQ8TDB6 740 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 MAIP1Q8WWC4 291 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 UBXN4Q92575 508 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 RMDN2Q96LZ7 410 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 VAT1Q99536 393 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 TRIM55Q9BYV6 548 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ACTL8Q9H568 366 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 FAM96AQ9H5X1 160 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PDE7BQ9NP56 450 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 FGF21Q9NSA1 209 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SMOXQ9NWM0 555 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 HRASLS2Q9NWW9 162 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 TLK1Q9UKI8 766 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 TRHDEQ9UKU6 1024 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 RARRES3Q9UL19 164 aa12.32□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 OR5K3A6NET4 321 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 MGAT4DA6NG13 374 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 KCNJ13O60928 360 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SRP72O76094 671 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 APOC2P02655 101 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 LPOP22079 712 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 GEMP55040 296 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 XIAPP98170 497 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 C2orf54Q08AI8 447 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CHAF1BQ13112 559 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SPARCL1Q14515 664 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CYP1B1Q16678 543 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 FAM69BQ5VUD6 431 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 RANBP10Q6VN20 620 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 MNS1Q8NEH6 495 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SPATA4Q8NEY3 305 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 OR2L2Q8NH16 312 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ACTL9Q8TC94 416 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 C1orf54Q8WWF1 131 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ATG4AQ8WYN0 398 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ASB8Q9H765 288 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 SLC24A2Q9UI40 661 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 KCND3Q9UK17 655 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 POLHQ9Y253 713 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 MED13Q9UHV7 2174 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CTAGE15A4D2H0 777 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 TLCD2A6NGC4 264 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 ANXA9O76027 345 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 CTAGE8P0CG41 777 aa12.3□□□□□ -0.44
PRAME-212ENST00000485532 PRSS56P0CW18 603 aa12.3□□□□□ -0.44
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