RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 STK40Q8N2I9 435 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 OR2T12Q8NG77 320 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SNX19Q92543 992 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 FIG4Q92562 907 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 KCNJ9Q92806 393 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ESAMQ96AP7 390 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CCDC115Q96NT0 180 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SERINC2Q96SA4 455 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TOR3AQ9H497 397 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 UPK1AO00322 258 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 DNAJB5O75953 348 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CLPXO76031 633 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TSPAN12O95859 305 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 AGR2O95994 175 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 OTCP00480 354 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CST1P01037 141 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ESR1P03372 595 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 PCNAP12004 261 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 JAK1P23458 1154 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CRHBPP24387 322 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 PTGER3P43115 390 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 OR1G1P47890 313 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 BMXP51813 675 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 MAPK10P53779 464 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 OCA2Q04671 838 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TAF10Q12962 218 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 BFSP2Q13515 415 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 NR1D2Q14995 579 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 PYCR3Q53H96 274 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TEX19Q8NA77 164 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CD200R1Q8TD46 325 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 PDE10AQ9Y233 779 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 FAM92AA1XBS5 289 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 A6NJY4 79 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 H0Y858 1186 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 RGS14O43566 566 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 B3GALNT1O75752 331 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SCELO95171 688 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TFPTP0C1Z6 253 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 DGKQP52824 942 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SELPLGQ14242 412 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 RGS21Q2M5E4 152 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 EFHBQ8N7U6 833 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 OR7D4Q8NG98 312 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 FBXO30Q8TB52 745 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 GPR152Q8TDT2 470 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 FAM162AQ96A26 154 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 ZNF583Q96ND8 569 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-210ENST00000480171 CDK15Q96Q40 435 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms