RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479344.1

USP21-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 2

Gene USP21, Length 709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-204ENST00000479344 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 FURINP09958 794 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 FOXN2P32314 431 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 POLE2P56282 527 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TUBB3Q13509 450 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SNX1Q13596 522 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 GSE1Q14687 1217 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 KLHL35Q6PF15 583 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 ZNF778Q96MU6 729 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 KLHL33A6NCF5 533 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TLCD2A6NGC4 264 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 CFAP99D6REC4 459 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 BTN3A3O00478 584 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SLC28A2O43868 658 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 DLSTP36957 453 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 CACNG1Q06432 222 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 GPR19Q15760 415 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 C16orf46Q6P387 395 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 OOSP2Q86WS3 158 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 D2HGDHQ8N465 521 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 PSMD3O43242 534 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SUN1O94901 812 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 IFNB1P01574 187 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 NTRK1P04629 796 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TMEM135Q86UB9 458 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 CD180Q99467 661 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 FGF21Q9NSA1 209 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 RARRES3Q9UL19 164 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 OR1I1O60431 355 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TPBGLP0DKB5 382 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 HSD11B2P80365 405 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 CDH17Q12864 832 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SEMA3AQ14563 771 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 CT55Q8WUE5 264 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TRIM4Q9C037 500 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SLC25A18Q9H1K4 315 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 XKR8Q9H6D3 395 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 PDE7BQ9NP56 450 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 LHX9Q9NQ69 397 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 POMT2Q9UKY4 750 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 BTN3A1O00481 513 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SUV39H1O43463 412 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 KRT86O43790 486 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SPTBP11277 2137 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TCN2P20062 427 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 NDUFS1P28331 727 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 CCR10P46092 362 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 PRKG2Q13237 762 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 KCNAB2Q13303 367 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 SEMA5AQ13591 1074 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 ZNF534Q76KX8 674 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 LINC00523Q86TU6 105 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 KMT5CQ86Y97 462 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 LCN9Q8WX39 176 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 HDAC10Q969S8 669 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 LRRC45Q96CN5 670 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 CASS4Q9NQ75 786 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 BTRCQ9Y297 605 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-204ENST00000479344 KATNA1O75449 491 aa20.45■□□□□ 0.86
USP21-204ENST00000479344 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms