RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	KPNA5	O15131	536 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	DUX1	O43812	170 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NIPSNAP2	O75323	286 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CS	O75390	466 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CPNE6	O95741	557 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	JUP	P14923	745 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ITGB6	P18564	788 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ACADL	P28330	430 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NDUFS1	P28331	727 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	FMO4	P31512	558 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CCKBR	P32239	447 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	GPR18	Q14330	331 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TMED2	Q15363	201 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ISX	Q2M1V0	245 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MAP9	Q49MG5	647 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SYTL3	Q4VX76	610 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	KRT222	Q8N1A0	295 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	OR10G6	Q8NH81	332 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	KCNJ9	Q92806	393 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM159	Q96B96	161 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	OGFR	Q9NZT2	677 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MED16	Q9Y2X0	877 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	HAUS5	O94927	633 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SLCO2B1	O94956	709 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	APOA4	P06727	396 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	GSTA2	P09210	222 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	GABRB3	P28472	473 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ATP5D	P30049	168 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ECHS1	P30084	290 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CAPZB	P47756	277 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CFHR1	Q03591	330 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MGAT5	Q09328	741 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	BRD3	Q15059	726 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	AMZ1	Q400G9	498 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CNST	Q6PJW8	725 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CYS1	Q717R9	158 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PIM3	Q86V86	326 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	VRK3	Q8IV63	474 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	GATA6	Q92908	595 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM74	Q96NL1	305 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	RDH14	Q9HBH5	336 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ZFAT	Q9P243	1243 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	PDP2	Q9P2J9	529 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887		E5RI56	91 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	UBXN7	O94888	489 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SFI1-222	ENST00000478887	C1QA	P02745	245 aa		9.24	□□□□□ -0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms