RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	C12orf66	Q96MD2	445 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	GBP5	Q96PP8	586 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	WWP1	Q9H0M0	922 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CHST11	Q9NPF2	352 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	MYO6	Q9UM54	1294 aa		10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	KCNK1	O00180	336 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	10.26	□□□□□ -0.77	4e-13	■□□□□ 9.3
APTX-222	ENST00000478279	AURKA	O14965	403 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	COX6B1	P14854	86 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	NDUFS1	P28331	727 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	LMAN1	P49257	510 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	GBE1	Q04446	702 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	TESK1	Q15569	626 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CYP2A13	Q16696	494 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	FCRL6	Q6DN72	434 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	NXPE1	Q8N323	547 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	HDAC11	Q96DB2	347 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CBX8	Q9HC52	389 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	IL26	Q9NPH9	171 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		10.26	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	GSAP	A4D1B5	854 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	MGAT4D	A6NG13	374 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	OR2AG2	A6NM03	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	AGPS	O00116	658 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	UGT1A9	O60656	530 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	JRK	O75564	520 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	NDST3	O95803	873 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	UGT1A6	P19224	532 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	UGT1A1	P22309	533 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	UGT1A4	P22310	534 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	HTR1E	P28566	365 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	HMGCL	P35914	325 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	KRT33B	Q14525	404 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	TLR1	Q15399	786 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	C1orf189	Q5VU69	101 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	GPR135	Q8IZ08	494 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	NACC2	Q96BF6	587 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	TADA1	Q96BN2	335 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	BTBD6	Q96KE9	485 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	AGAP4	Q96P64	663 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ZNF670	Q9BS34	389 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	OLAH	Q9NV23	265 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		10.25	□□□□□ -0.77
APTX-222	ENST00000478279	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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