RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	KCNK6	Q9Y257	313 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SBF1-208	ENST00000477234	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SBF1-208	ENST00000477234	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PEX12	O00623	359 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	MAP3K7	O43318	606 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	GRID2	O43424	1007 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	ZG16	O60844	167 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	EML2	O95834	649 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	SOD1	P00441	154 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	STS	P08842	583 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CD48	P09326	243 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CD1E	P15812	388 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	ERCC2	P18074	760 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	VCL	P18206	1134 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	MX2	P20592	715 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CA4	P22748	312 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	LHCGR	P22888	699 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	IL4R	P24394	825 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	FNTA	P49354	379 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	HSD11B2	P80365	405 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	LAMB3	Q13751	1172 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	DPYS	Q14117	519 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CCNG2	Q16589	344 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	KYNU	Q16719	465 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CARD6	Q9BX69	1037 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	HACD1	B0YJ81	288 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234		C9J4A7	227 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	DFFA	O00273	331 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	NUAK1	O60285	661 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PHF2	O75151	1096 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PGLS	O95336	258 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	GAS8	O95995	478 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CES1	P23141	567 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	EPHB1	P54762	984 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	DYNLT1	P63172	113 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	ADCY2	Q08462	1091 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	XRCC4	Q13426	336 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CYP1B1	Q16678	543 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	LRRC66	Q68CR7	880 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	AADACL2	Q6P093	401 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234		Q6ZS92	163 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	NXPE1	Q8N323	547 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PLD5	Q8N7P1	536 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CD84	Q9UIB8	345 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	TLCD2	A6NGC4	264 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	MEN1	O00255	615 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	HBQ1	P09105	142 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	AGXT	P21549	392 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	AMPD1	P23109	780 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	HAL	P42357	657 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PLCL1	Q15111	1095 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PDK1	Q15118	436 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	NOMO1	Q15155	1222 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	RPTN	Q6XPR3	784 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	TRIM74	Q86UV6	250 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	KCNMB4	Q86W47	210 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	GALNT16	Q8N428	558 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	D2HGDH	Q8N465	521 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	PQLC3	Q8N755	202 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	ACTL9	Q8TC94	416 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	SCAMP4	Q969E2	229 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	RELT	Q969Z4	430 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	CHST8	Q9H2A9	424 aa		12	□□□□□ -0.49
SBF1-208	ENST00000477234	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		12	□□□□□ -0.49

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