RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 RAPSNQ13702 412 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PTGR1Q14914 329 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ACOX1Q15067 660 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 GTDC1Q4AE62 458 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 FBXL22Q6P050 247 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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RARB-204ENST00000458646 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DPP9Q86TI2 863 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PLPP6Q8IY26 295 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SCAIQ8N9R8 606 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 GTF2H4Q92759 462 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 LINGO1Q96FE5 620 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ITCHQ96J02 903 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CCDC138Q96M89 665 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.49□□□□□ -1.37
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RARB-204ENST00000458646 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 M0QX08 132 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 BCKDKO14874 412 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 HS6ST1O60243 411 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PRAMEF11O60813 436 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 B3GAT3O94766 335 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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RARB-204ENST00000458646 OR4Q2P0C623 313 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ITGAMP11215 1152 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PFKLP17858 780 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RYKP34925 604 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PBX3P40426 434 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 MAP2K4P45985 399 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RGRP47804 291 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SLC35A2P78381 396 aa6.49□□□□□ -1.37
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RARB-204ENST00000458646 CDK5R2Q13319 367 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.49□□□□□ -1.37
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RARB-204ENST00000458646 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 GPR149Q86SP6 731 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 GPSM1Q86YR5 675 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 AADATQ8N5Z0 425 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OR10A6Q8NH74 314 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 S100ZQ8WXG8 99 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 STARD8Q92502 1023 aa6.49□□□□□ -1.37
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RARB-204ENST00000458646 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.49□□□□□ -1.37
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RARB-204ENST00000458646 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CPA4Q9UI42 421 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 C3orf18Q9UK00 162 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.49□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PTGES3LE9PB15 166 aa6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PDHXO00330 501 aa6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CXCR6O00574 342 aa6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 AREL1O15033 823 aa6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RAMP2O60895 175 aa6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 RETP07949 1114 aa6.48□□□□□ -1.37
RARB-204ENST00000458646 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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