RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 MOB3AQ96BX8 217 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 AP2M1Q96CW1 435 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SFXN2Q96NB2 322 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PANX3Q96QZ0 392 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6C1Q96RD1 312 aa4.57□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.57□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 H0YGN5 161 aa4.56□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF217O75362 1048 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD51DO75771 328 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 DIRAS3O95661 229 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SBK2P0C263 348 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2T7P0C7T2 308 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPY4P0CV99 314 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPY10P0CW01 314 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 G6PDP11413 515 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CD22P20273 847 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 KELP23276 732 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ACP1P24666 158 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMB4P28070 264 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 ME1P48163 572 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 RGS7P49802 495 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 HTR6P50406 440 aa4.56□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A3Q00325 362 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TCTE1Q5JU00 501 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 DCST1Q5T197 706 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 AMER3Q8N944 861 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 BICD2Q8TD16 824 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ERGIC1Q969X5 290 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB7BQ96AH8 199 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SGF29Q96ES7 293 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 DTNBP1Q96EV8 351 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA33Q96N06 139 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 GFI1Q99684 422 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SEMA3CQ99985 751 aa4.56□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.56□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 MYNNQ9NPC7 610 aa4.56□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 KCNN3Q9UGI6 736 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF150Q9ULK6 438 aa4.56□□□□□ -1.68
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CBX1P4-201ENST00000439415 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 NME7Q9Y5B8 376 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAMTS12P58397 1594 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM90A10PA6NDY2 464 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM221A6NGB7 291 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 DUXAA6NLW8 204 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 J3QR06 171 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TO15178 435 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC16A5O15375 505 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 XRCC3O43542 346 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 JTBO76095 146 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF202O95125 648 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 ACSL3O95573 720 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN15O95858 294 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1P4-201ENST00000439415 EGFP01133 1207 aa4.55□□□□□ -1.68
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