RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa26.54■■□□□ 1.84
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LMO1-202ENST00000428101 DEFB109BQ30KR1 87 aa26.53■■□□□ 1.84
LMO1-202ENST00000428101 STYXQ8WUJ0 223 aa26.53■■□□□ 1.84
LMO1-202ENST00000428101 OR52A5Q9H2C5 316 aa26.53■■□□□ 1.84
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LMO1-202ENST00000428101 PADI1Q9ULC6 663 aa26.52■■□□□ 1.84
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LMO1-202ENST00000428101 ARL4DP49703 201 aa26.5■■□□□ 1.83
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LMO1-202ENST00000428101 KRT33BQ14525 404 aa26.5■■□□□ 1.83
LMO1-202ENST00000428101 DBN1Q16643 649 aa26.5■■□□□ 1.83
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LMO1-202ENST00000428101 ABHD17AQ96GS6 310 aa26.47■■□□□ 1.83
LMO1-202ENST00000428101 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
LMO1-202ENST00000428101 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa26.47■■□□□ 1.83
LMO1-202ENST00000428101 OR51F1A6NGY5 319 aa26.46■■□□□ 1.83
LMO1-202ENST00000428101 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa26.46■■□□□ 1.83
LMO1-202ENST00000428101 C21orf140B9A014 251 aa26.46■■□□□ 1.83
LMO1-202ENST00000428101 BTN3A3O00478 584 aa26.46■■□□□ 1.83
LMO1-202ENST00000428101 CREG1O75629 220 aa26.46■■□□□ 1.83
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