RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 CD274Q9NZQ7 290 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CCL26Q9Y258 94 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 MYLKQ15746 1914 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 TSPAN11A1L157 253 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM233B4DJY2 109 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 QSOX1O00391 747 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 AIM2O14862 343 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CRCPO75575 148 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 EPN2O95208 641 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 LBPP18428 481 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 PSMD8P48556 350 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 NUDT2P50583 147 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 DCDC1P59894 354 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 PTK2BQ14289 1009 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 RCN1Q15293 331 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 TGFBIQ15582 683 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CHRNA6Q15825 494 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 GEN1Q17RS7 908 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SPATS1Q496A3 300 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 COQ5Q5HYK3 327 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ZBTB2Q8N680 514 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 PDPRQ8NCN5 879 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 GAB3Q8WWW8 586 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 EXT2Q93063 718 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ROPN1LQ96C74 230 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 COPS8Q99627 209 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 HGH1Q9BTY7 390 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 VCX3BQ9H321 246 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ACSS2Q9NR19 701 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SMOXQ9NWM0 555 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 DKK3Q9UBP4 350 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 PCTPQ9UKL6 214 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SARDHQ9UL12 918 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 OARD1Q9Y530 152 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SPEGQ15772 3267 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 MEI4A8MW99 385 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CFAP99D6REC4 459 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 KRT36O76013 467 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 AP2A2O94973 939 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 KCNK5O95279 499 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 MATN4O95460 622 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ADH1CP00326 375 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 OR56A5P0C7T3 313 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 IDO1P14902 403 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 MSH3P20585 1137 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 VIPR1P32241 457 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CTHP32929 405 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 PIK3CGP48736 1102 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SPINT3P49223 89 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 CDH13P55290 713 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 PTSQ03393 145 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 ARHGEF7Q14155 803 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SMU1Q2TAY7 513 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM198Q66K66 360 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC66Q68CR7 880 aa9.86□□□□□ -0.83
POLR1A-204ENST00000424089 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms