RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 ZMYND15Q9H091 742 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 POT1Q9NUX5 634 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 OR1I1O60431 355 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CPNE6O95741 557 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 VIPP01282 170 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 GSTM1P09488 218 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 EPHA4P54764 986 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 OR1D5P58170 312 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 MPP1Q00013 466 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 GSTM4Q03013 218 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 NFE2L1Q14494 772 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 AMZ1Q400G9 498 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 LPGAT1Q92604 370 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.35■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 AKAP13Q12802 2813 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 LILRA5A6NI73 299 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 FAM159BA6NKW6 160 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SGTAO43765 313 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 DUX1O43812 170 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 S1PR4O95977 384 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ABHD2P08910 425 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 OR56A5P0C7T3 313 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CCKBRP32239 447 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PDX1P52945 283 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 INHBCP55103 352 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 NAB1Q13506 487 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 RTP5Q14D33 572 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 GALNT7Q86SF2 657 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PIM3Q86V86 326 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CYTH2Q99418 400 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 FUT8Q9BYC5 575 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 UCK1Q9HA47 277 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 DKK4Q9UBT3 224 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 UNC13CQ8NB66 2214 aa20.34■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 RIPK2O43353 540 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 B4GAT1O43505 415 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 BRAFP15056 766 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CD151P48509 253 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 METRNLQ641Q3 311 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 NAT14Q8WUY8 206 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CAVIN3Q969G5 261 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CCM2Q9BSQ5 444 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 P2RY12Q9H244 342 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC68Q9H2F9 335 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 AK5Q9Y6K8 562 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.33■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.33■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.32■□□□□ 0.84
C4orf48-201ENST00000409248 H3BMM5 538 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms