RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 NAA20P61599 178 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC25A3Q00325 362 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 MESP2Q0VG99 397 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 TGFBIQ15582 683 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 IRGCQ6NXR0 463 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ZBTB2Q8N680 514 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NXPE3Q969Y0 559 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM161BQ96MY7 647 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 THTPAQ9BU02 230 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 GDE1Q9NZC3 331 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 DEC1Q9P2X7 70 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.84□□□□□ -0.83
LRRTM4-202ENST00000409093 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PRRT4C9JH25 899 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 AZIN1O14977 448 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TMCC2O75069 709 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF254O75437 659 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CRCPO75575 148 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ACADSP16219 412 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC6A11P48066 632 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RXRGP48443 463 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GALK1P51570 392 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 C19orf60Q96EN9 201 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PANX3Q96QZ0 392 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 UQCC2Q9BRT2 126 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PARVBQ9HBI1 364 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ENTPD5O75356 428 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TM7SF2O76062 418 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FGF4P08620 206 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 THRAP10827 490 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TIMP2P16035 220 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GM2AP17900 193 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 AKT1P31749 480 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FOXA1P55317 472 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB30Q15771 203 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RBBP7Q16576 425 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 MUM1Q2TAK8 710 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GPRC6AQ5T6X5 926 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 KANK2Q63ZY3 851 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SBSNQ6UWP8 590 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GPR149Q86SP6 731 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 SNX32Q86XE0 403 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PELI3Q8N2H9 469 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ESAMQ96AP7 390 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CLPTM1LQ96KA5 538 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNA7Q96RP8 456 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 HGH1Q9BTY7 390 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 PCTPQ9UKL6 214 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 COL4A3Q01955 1670 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 NOTOA8MTQ0 251 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RFXAPO00287 272 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GIPC1O14908 333 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 UBDO15205 165 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 RAD51BO15315 384 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 GPC4O75487 556 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP6AP2O75787 350 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 CIB2O75838 187 aa9.82□□□□□ -0.84
LRRTM4-202ENST00000409093 MLYCDO95822 493 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms