RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 ABRQ12979 859 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 LCP2Q13094 533 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 ZNF284Q2VY69 593 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 C19orf60Q96EN9 201 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 DTD2Q96FN9 168 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 NRTNQ99748 197 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 GULP1Q9UBP9 304 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PDE10AQ9Y233 779 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 A0A1W2PP55 124 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 AIM2O14862 343 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 APODP05090 189 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 ASGR2P07307 311 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 OR56A5P0C7T3 313 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 RGS4P49798 205 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PTPN5P54829 565 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 CUL3Q13618 768 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 KANK2Q63ZY3 851 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PHC3Q8NDX5 983 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 OR2T11Q8NH01 316 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 OR2AG1Q9H205 316 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.68□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 IGLON5A6NGN9 336 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 EGFP01133 1207 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 NUMA1Q14980 2115 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PON2Q15165 354 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 LGR4Q9BXB1 951 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 FFAR3O14843 346 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 GPR42O15529 346 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PDE5AO76074 875 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 COL9A1P20849 921 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PGM1P36871 562 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 HTR4Q13639 388 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 CRY1Q16526 586 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 DOK6Q6PKX4 331 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 PAOXQ6QHF9 649 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 UCMAQ8WVF2 138 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 ULK4Q96C45 1275 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 NPAS2Q99743 824 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 DYRK4Q9NR20 520 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 OARD1Q9Y530 152 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 STX16O14662 325 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 RPIAP49247 311 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 RASSF2P50749 326 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 COPAP53621 1224 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 DCDC1P59894 354 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 GTF2H2Q13888 395 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 NUS1Q96E22 293 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 TRMOQ9BU70 441 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 IPPKQ9H8X2 491 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-202ENST00000393119 SMOXQ9NWM0 555 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms