RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MS4A14Q96JA4 679 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC1Q99614 292 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 IL22Q9GZX6 179 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.07■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TK2O00142 265 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3BP2P78314 561 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PRAMEP78395 509 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC27Q6P3X3 843 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35F6Q8N357 371 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 UBXN4Q92575 508 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CD180Q99467 661 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 BFARQ9NZS9 450 aa20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 OR1I1O60431 355 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD1O60671 282 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 FTH1P02794 183 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 OR56A5P0C7T3 313 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CRADDP78560 199 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXM1Q08050 763 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT33BQ14525 404 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP1B1Q16678 543 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 OOSP2Q86WS3 158 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC9Q92623 222 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 WBP1Q96G27 269 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 OR6C1Q96RD1 312 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K3Q99759 626 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TREX1Q9NSU2 369 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGEA6P43360 314 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PREPP48147 710 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SEMA3AQ14563 771 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 IL11RAQ14626 422 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC39A7Q92504 469 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ELMO1Q92556 727 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.04■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 OR6C74A6NCV1 312 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TLCD2A6NGC4 264 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 F8W8V4 182 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 STK17BO94768 372 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 DLGAP3O95886 979 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT14P02533 472 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 GPS1Q13098 491 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNJ11Q14654 390 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 KMT5CQ86Y97 462 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 COG1Q8WTW3 980 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 KIFC1Q9BW19 673 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.03■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF5CO60282 957 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 FGF5P12034 268 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MGAT1P26572 445 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ACADLP28330 430 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 NMBRP28336 390 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS41P49754 854 aa20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms