RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 COPG2Q9UBF2 871 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 MGAT4DA6NG13 374 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 DLX3O60479 287 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SLCO2B1O94956 709 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 GUCA1CO95843 209 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 APOA4P06727 396 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 COL6A2P12110 1019 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 BGNP21810 368 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 DGKAP23743 735 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 CD38P28907 300 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 MDH1P40925 334 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 RABIFP47224 123 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.772e-8■■■□□ 17.3
TMCO3-201ENST00000375391 C1orf61Q13536 156 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SLC36A4Q6YBV0 504 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM159Q96B96 161 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 KLHDC7BQ96G42 594 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 ATOH8Q96SQ7 321 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 KLQ9UEF7 1012 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 ASB1Q9Y576 335 aa19.87■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 MYO1CO00159 1063 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 HTR1BP28222 390 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 PLK5Q496M5 336 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 PHC3Q8NDX5 983 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 GAB3Q8WWW8 586 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA1191Q96A73 305 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TSNARE1Q96NA8 513 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 PRDM8Q9NQV8 689 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 GPR27Q9NS67 375 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF318Q5VUA4 2279 aa19.86■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SNX2O60749 519 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 GSTA1P08263 222 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SP9P0CG40 484 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 ARRB2P32121 409 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 CTBSQ01459 385 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SLC30A9Q6PML9 568 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 LPCAT2Q7L5N7 544 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 MYO1HQ8N1T3 1032 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 DYDC1Q8WWB3 177 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 DNASE2BQ8WZ79 361 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 KMOO15229 486 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 CPA3P15088 417 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SLC18A1P54219 525 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 YPEL5P62699 121 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 RACK1P63244 317 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 PMS2CLQ68D20 193 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 RASSF4Q9H2L5 321 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 RNF112Q9ULX5 631 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 CACNA1EQ15878 2313 aa19.85■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 OR52A4PA6NMU1 304 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TNFRSF10AO00220 468 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 BPGMP07738 259 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SLC26A3P40879 764 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 BDKRB1P46663 353 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 RGS4P49798 205 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 AGTR2P50052 363 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 PPP1R3AQ16821 1122 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TTLL9Q3SXZ7 439 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 KLC3Q6P597 504 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 OR52A5Q9H2C5 316 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJC28Q9NX36 388 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 H3BM21 787 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 QSOX1O00391 747 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 CLCNKAP51800 687 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SEC24CP53992 1094 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TGFBIQ15582 683 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 PFKFB4Q16877 469 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC153Q494R4 210 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 METRNLQ641Q3 311 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 NRROSQ86YC3 692 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 SLC22A15Q8IZD6 547 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 ASB11Q8WXH4 323 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 OR2M4Q96R27 311 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 TBC1D29Q9UFV1 150 aa19.84■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
TMCO3-201ENST00000375391 A8MT66 165 aa19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms