RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMP3P35625 211 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 NR2C2P49116 596 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 LMAN1P49257 510 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 THOP1P52888 689 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK3Q00526 305 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MFAP5Q13361 173 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 NR1D2Q14995 579 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 GRTP1Q5TC63 336 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC27A1Q6PCB7 646 aa3.61□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MTERF3Q96E29 417 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF354BQ96LW1 612 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 APOL6Q9BWW8 343 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 PELI2Q9HAT8 420 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 TERF2IPQ9NYB0 399 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM169AQ9Y6X4 670 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 NOTCH4Q99466 2003 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PPE2 198 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PR64 198 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MED24O75448 989 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 CSPG5O95196 566 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SP1P08047 785 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 ANOS1P23352 680 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 LIG4P49917 911 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH13P55290 713 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 CBWD6Q4V339 395 aa3.6□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.6□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS1P07477 247 aa3.59□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 RPS18P62269 152 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 SNAPC1Q16533 368 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 TECRLQ5HYJ1 363 aa3.59□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.59□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZTC4 211 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGGTB-202ENST00000370826 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa3.59□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 OR2T12Q8NG77 320 aa3.59□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 DUXAA6NLW8 204 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6C76A6NM76 312 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-202ENST00000370826 P4HA2O15460 535 aa3.58□□□□□ -1.84
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