RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 NOMO3P69849 1222 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CDK3Q00526 305 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 BCL2L1Q07817 233 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 LAPTM5Q13571 262 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 RAPSNQ13702 412 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CNGA3Q16281 694 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CAMK4Q16566 473 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CPZQ66K79 652 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 PNCKQ6P2M8 343 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CLEC18BQ6UXF7 455 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 TSPAN33Q86UF1 283 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CLEC18CQ8NCF0 446 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 MSANTD4Q8NCY6 345 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 SLC45A3Q96JT2 553 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 C16orf92Q96LL3 132 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 NSMCE3Q96MG7 304 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CATSPER2Q96P56 530 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 MCEEQ96PE7 176 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 OR2M4Q96R27 311 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 RUFY1Q96T51 708 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 DKK3Q9UBP4 350 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 CROTQ9UKG9 612 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 TLK1Q9UKI8 766 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 KCNK6Q9Y257 313 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 ATP23Q9Y6H3 246 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 BSNQ9UPA5 3926 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.72□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.71□□□□□ -1.65
TMLHE-202ENST00000369439 A0A087WV62 115 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 TSPAN11A1L157 253 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 PIPSLA2A3N6 862 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 C7orf72A4D263 438 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 ARGFXA6NJG6 315 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 ENO4A6NNW6 628 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.663e-10■■■□□ 17.2
TMLHE-202ENST00000369439 SCDO00767 359 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 DAPK3O43293 454 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 MAFKO60675 156 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 RASSF9O75901 435 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 KIAA0754O94854 1291 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 ALX3O95076 343 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 CBX7O95931 251 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 SLC4A1P02730 911 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 ACP5P13686 325 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 PNLIPP16233 465 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 GPD1P21695 349 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 LHCGRP22888 699 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 CASP14P31944 242 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 PPP1R2P41236 205 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 PIK3CBP42338 1070 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 GPR1P46091 355 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 GABRB2P47870 512 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 HHEXQ03014 270 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 DOC2BQ14184 412 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF235Q14590 738 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 CA9Q16790 459 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 MUM1Q2TAK8 710 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 NADK2Q4G0N4 442 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC38Q502W7 563 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.71□□□□□ -1.66
TMLHE-202ENST00000369439 RNF111Q6ZNA4 994 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms