RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 ASB8Q9H765 288 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 CDH1P12830 882 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 CLPBQ9H078 707 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 PFDN4Q9NQP4 134 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 ANXA6P08133 673 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 PSMA3P25788 255 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 ARSFP54793 590 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 PIGFQ07326 219 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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HOXB3-201ENST00000311626 CD320Q9NPF0 282 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 SLC6A13Q9NSD5 602 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 PKD2L2Q9NZM6 624 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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HOXB3-201ENST00000311626 GSTA4O15217 222 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 CLDN7O95471 211 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 TFPTP0C1Z6 253 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 IL7RP16871 459 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 PWP1Q13610 501 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXB3-201ENST00000311626 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
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HOXB3-201ENST00000311626 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.89■■□□□ 1.58
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HOXB3-201ENST00000311626 XKR5Q6UX68 686 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 USP51Q70EK9 711 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 LIX1Q8N485 282 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
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HOXB3-201ENST00000311626 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 TRIM64A6NGJ6 449 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 H7C4K7 107 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 PRKACGP22612 351 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 TAF12Q16514 161 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 FEM1AQ9BSK4 669 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 FANCEQ9HB96 536 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 EXD2Q9NVH0 621 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 WWOXQ9NZC7 414 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF639Q9UID6 485 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 CCL27Q9Y4X3 112 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 GGT1P19440 569 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 MATN1P21941 496 aa24.88■■□□□ 1.57
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HOXB3-201ENST00000311626 TBC1D25Q3MII6 688 aa24.88■■□□□ 1.57
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HOXB3-201ENST00000311626 APCDD1Q8J025 514 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa24.88■■□□□ 1.57
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HOXB3-201ENST00000311626 HIPK3Q9H422 1215 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 ADGRE2Q9UHX3 823 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 A0A1W2PQY0 241 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 KRT87PA6NCN2 255 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 RAD51BO15315 384 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 SPATS1Q496A3 300 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 C10orf111Q8N326 155 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 OR2T12Q8NG77 320 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 KCNH1O95259 989 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 OTCP00480 354 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 GSNP06396 782 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 MYBPC3Q14896 1274 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 IMPG1Q17R60 797 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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HOXB3-201ENST00000311626 SLC13A3Q8WWT9 602 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 MYO19Q96H55 970 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 ING2Q9H160 280 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 TOR3AQ9H497 397 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 LOC730098B7Z3J9 87 aa24.86■■□□□ 1.57
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HOXB3-201ENST00000311626 BNIP3LO60238 219 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 SEC22BO75396 215 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 DAG1Q14118 895 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 ARMC12Q5T9G4 340 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 SUSD1Q6UWL2 747 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 MSRB3Q8IXL7 192 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 SLC22A15Q8IZD6 547 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 PIH1D2Q8WWB5 315 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXB3-201ENST00000311626 GTF2H4Q92759 462 aa24.86■■□□□ 1.57
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