RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 GMPRP36959 345 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF460Q14592 562 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 GPATCH11Q8N954 259 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 UBXN4Q92575 508 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 HALP42357 657 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 GPR18Q14330 331 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 GBX1Q14549 363 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 KIR2DS5Q14953 304 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 SYTL3Q4VX76 610 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 CD200R1Q8TD46 325 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.88□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 GLMNQ92990 594 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 OR5K4A6NMS3 321 aa8.87□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 TPBGLP0DKB5 382 aa8.87□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 PMS2P54278 862 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R39P59534 338 aa8.87□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.87□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 DHRS7Q9Y394 339 aa8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.87□□□□□ -0.99
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