RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 MIPEPQ99797 713 aa10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 SLC12A9Q9BXP2 914 aa10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 TRIM54Q9BYV2 358 aa10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 KCNK12Q9HB15 430 aa10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ARL15Q9NXU5 204 aa10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 OPTCQ9UBM4 332 aa10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PDE10AQ9Y233 779 aa10.3□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 IGLON5A6NGN9 336 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PIP5K1BO14986 540 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 TAPBPO15533 448 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MBTPS2O43462 519 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ADAM23O75077 832 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 GPC4O75487 556 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 SLCO2B1O94956 709 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 CHEK2O96017 543 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PCCBP05166 539 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 GSTM1P09488 218 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 CYP2A7P20853 494 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PRDX6P30041 224 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 RPIAP49247 311 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MNAT1P51948 309 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 GSTM4Q03013 218 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 NAA25Q14CX7 972 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 CYB5D1Q6P9G0 228 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 DDIASQ8IXT1 998 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 TCAIMQ8N3R3 496 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 POU5F2Q8N7G0 328 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 OR52B6Q8NGF0 335 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 GANCQ8TET4 914 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ASB11Q8WXH4 323 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MARK4Q96L34 752 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 CD244Q9BZW8 370 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 OR2AG1Q9H205 316 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PARVBQ9HBI1 364 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MRGBPQ9NV56 204 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MEI4A8MW99 385 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 B2RBV5 119 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 RASSF9O75901 435 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 OTCP00480 354 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 DNTTP04053 509 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 UROSP10746 265 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 EZRP15311 586 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 HIST1H2ADP20671 130 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PIK3R1P27986 724 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 AP1S2P56377 157 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MXRA7P84157 204 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 CDC16Q13042 620 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 LONP2Q86WA8 852 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 HEATR4Q86WZ0 1026 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 HIC2Q96JB3 615 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 HIST1H2AJQ99878 128 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 H2AFJQ9BTM1 129 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 FBXL12Q9NXK8 326 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ATXN10Q9UBB4 475 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ZNF225Q9UK10 706 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 BTRCQ9Y297 605 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.29□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 A0A1W2PQF6 199 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 SLC5A10A0PJK1 596 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 GFYI3L273 518 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 K7EPI3 171 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 OR7A17O14581 309 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 VEGFDO43915 354 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 LILRB5O75023 590 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 ATP6AP2O75787 350 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 OR4F21O95013 312 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 COL9A1P20849 921 aa10.28□□□□□ -0.76
COPS2-201ENST00000299259 MAPK9P45984 424 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms