RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 K7ESM1 405 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 C6P13671 934 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 GRIA2P42262 883 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ATP4BP51164 291 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TRAF3Q13114 568 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 KIF19Q2TAC6 998 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf89Q6UX73 402 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 HPS6Q86YV9 775 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 METTL6Q8TCB7 284 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ASB11Q8WXH4 323 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN6O43657 245 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 FTH1P02794 183 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ANXA5P08758 320 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 GPX3P22352 226 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 HTR6P50406 440 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 STX1BP61266 288 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CDC16Q13042 620 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 DCLRE1BQ9H816 532 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.31■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ARNTLO00327 626 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 KPNA5O15131 536 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 OTCP00480 354 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PRR35P0CG20 571 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MPC1LP0DKB6 136 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 P2RY2P41231 377 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CCNG1P51959 295 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ACTR3P61158 418 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ART3Q13508 389 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CACUL1Q86Y37 369 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 NUS1Q96E22 293 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PARVBQ9HBI1 364 aa22.3■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 KRT87PA6NCN2 255 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 K7EPI3 171 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 FBP2O00757 339 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 VPS4BO75351 444 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PSMG1O95456 288 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 C8GP07360 202 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MAPRE2Q15555 327 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MILR1Q7Z6M3 343 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM74Q86UV6 250 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 HBEGFQ99075 208 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CFLARO15519 480 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 APODP05090 189 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 DPP6P42658 865 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 DIO3P55073 304 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MTTPP55157 894 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 RCN1Q15293 331 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 STMN2Q93045 179 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD8Q96I13 439 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 WDR41Q9HAD4 459 aa22.29■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 STK16O75716 305 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CNTN1Q12860 1018 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 GFYI3L273 518 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 SLCO2B1O94956 709 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 PRLHRP49683 370 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 ACADVLP49748 655 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 STX5Q13190 355 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MMEL1Q495T6 779 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 REP15Q6BDI9 236 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZSR9 355 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CHPFQ8IZ52 775 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 MIER2Q8N344 545 aa22.28■■□□□ 1.16
VSTM4-201ENST00000298454 CDRT15Q96T59 188 aa22.28■■□□□ 1.16
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