RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FKTNO75072 461 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KRT33AO76009 404 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 APODP05090 189 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 MAGP20916 626 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CPA6Q8N4T0 437 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 IRAK2O43187 625 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A9O60656 530 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SMPD1P17405 629 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 HCAR3P49019 387 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF516Q92618 1163 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TESMINQ9Y4I5 508 aa20.84■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 EOMESO95936 686 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 CMPK1P30085 196 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RAB15P59190 212 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL18Q96ME1 805 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FAM159BA6NKW6 160 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 hCG_2039718K7EN88 272 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 K7EPI3 171 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 RLN1P04808 185 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 S100A1P23297 94 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM110Q86TL2 294 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3R3Q92569 461 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 KCNN2Q9H2S1 579 aa20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CCSAP-201ENST00000284617 TLL1O43897 1013 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 S100GP29377 79 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MYBPC3Q14896 1274 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA9Q16795 377 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF599Q96NL3 588 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 IL1R2P27930 398 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GPR135Q8IZ08 494 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.83■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 XKRYO14609 159 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FNIP2Q9P278 1114 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 M0R2N6 131 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 KCNA10Q16322 511 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CHADLQ6NUI6 762 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC36Q8IYA8 594 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SNX7Q9UNH6 387 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 VIPP01282 170 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TIE1P35590 1138 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MERTKQ12866 999 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 EBPLQ9BY08 206 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TBX10O75333 385 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PGRP06401 933 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FAM163BP0C2L3 166 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MTPNP58546 118 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 AHI1Q8N157 1196 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SNX33Q8WV41 574 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 COPS4Q9BT78 406 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.82■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GADD45GO95257 159 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA6P05013 189 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA8P13928 327 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 AP3S2P59780 193 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH1Q08174 1060 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GPR33Q49SQ1 333 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 UTS2BQ765I0 119 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms