RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283351.8

TRAPPC8-201, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC8, Length 6,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-201ENST00000283351 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SGCDQ92629 289 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ESAMQ96AP7 390 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PPM1MQ96MI6 270 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ING3Q9NXR8 418 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 IRAK3Q9Y616 596 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CASZ1Q86V15 1759 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CDC7O00311 574 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 IRAK2O43187 625 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NR2F6P10588 404 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 BTN3A2P78410 334 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ELOCQ15369 112 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PDK4Q16654 411 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ELOA3BQ3SY89 546 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ELOA3Q8NG57 546 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 OR52J3Q8NH60 311 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MAPK15Q8TD08 544 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SUSD3Q96L08 255 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 LEFTY2O00292 366 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PGRMC2O15173 223 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 C8GP07360 202 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 COX4I1P13073 169 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF611Q8N823 705 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 OR2T12Q8NG77 320 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NXNL1Q96CM4 212 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ARL5AQ9Y689 179 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SOD2P04179 222 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SYPP08247 313 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC26A3P40879 764 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SELENOVP59797 346 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 BST1Q10588 318 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 Q9Y3F1 56 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MMP8P22894 467 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PPP3R1P63098 170 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF844Q08AG5 666 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC1A5Q15758 541 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 DGUOKQ16854 277 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ANKRD46Q86W74 232 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NAXEQ8NCW5 288 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 BRD7Q9NPI1 651 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ACADLP28330 430 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CTSKP43235 329 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NOMO1Q15155 1222 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SATL1Q86VE3 508 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 NKD1Q969G9 470 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TCAF1Q9Y4C2 921 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 REREQ9P2R6 1566 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MUSKO15146 869 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 RHOP08100 348 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 HKDC1Q2TB90 917 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 IL23RQ5VWK5 629 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PIGUQ9H490 435 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 PDPK1O15530 556 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ASNA1O43681 348 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 METTL21CQ5VZV1 264 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC34A3Q8N130 599 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 MECRQ9BV79 373 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 IL21RQ9HBE5 538 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SERPINA3P01011 423 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SLC38A4Q969I6 547 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 C2P06681 752 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 SMCO1Q147U7 214 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC8-201ENST00000283351 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms