RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 TC2NQ8N9U0 490 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 GPR150Q8NGU9 434 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 TSGA13Q96PP4 275 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 VPS35Q96QK1 796 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 TLR10Q9BXR5 811 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 PSMD13Q9UNM6 376 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 TMEM150CB9EJG8 249 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 LDB2O43679 373 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 POP7O75817 140 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 SLC4A1P02730 911 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 HLA-DQB2P05538 268 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 STSP08842 583 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 CCDC175P0C221 793 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 CDH3P22223 829 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 PREPP48147 710 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 SOX8P57073 446 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 DMTNQ08495 405 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 DMPKQ09013 629 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 ABRQ12979 859 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 TMTC1Q8IUR5 882 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 KRT222Q8N1A0 295 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 OR1L3Q8NH93 324 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 GRHL3Q8TE85 626 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 FAR1Q8WVX9 515 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 LURAP1Q96LR2 239 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 AGAP3Q96P47 875 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 CHST11Q9NPF2 352 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 MED13LQ71F56 2210 aa11.65□□□□□ -0.54
SPC25-201ENST00000282074 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 E7EQ34 232 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MATN2O00339 956 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 LCA5LO95447 670 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MSL3P1P0C860 447 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 GZMAP12544 262 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 BPIP17213 487 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MX2P20592 715 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FOLR3P41439 243 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 GALNT3Q14435 633 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MLIPQ5VWP3 458 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FJX1Q86VR8 437 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PPP4R1Q8TF05 950 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TRIM11Q96F44 468 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF711Q9Y462 761 aa11.65□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PQJ5 194 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MFSD11O43934 449 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MMP2P08253 660 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PIRTP0C851 137 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MYBL1P10243 752 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TCF4P15884 667 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 UBXN1Q04323 297 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CDC16Q13042 620 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KRT33BQ14525 404 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CYP2A13Q16696 494 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 METRNLQ641Q3 311 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FCRL6Q6DN72 434 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 GPR135Q8IZ08 494 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CCNYQ8ND76 341 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF592Q92610 1267 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms