RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CD247P20963 164 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PRAMEP78395 509 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 BNIP3Q12983 259 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 UGP2Q16851 508 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf27AQ580R0 203 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 USP45Q70EL2 814 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 HM13Q8TCT9 377 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 DKK3Q9UBP4 350 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 OR51F1A6NGY5 319 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 NPC1O15118 1278 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GLULP15104 373 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 DRD1P21728 446 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PSMA3P25788 255 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 NR1D2Q14995 579 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC153Q494R4 210 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 FAM156AQ8NDB6 213 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 TMIEQ8NEW7 156 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 SGF29Q96ES7 293 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 BPIFA1Q9NP55 256 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN7O95471 211 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ME2P23368 584 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PIK3R1P27986 724 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 HMGCLP35914 325 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 RGS21Q2M5E4 152 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 FGD3Q5JSP0 725 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CRTC1Q6UUV9 634 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 NAPRTQ6XQN6 538 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 FAM47BQ8NA70 645 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 STARD8Q92502 1023 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 SNX15Q9NRS6 342 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GID8Q9NWU2 228 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 IL17CQ9P0M4 197 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP12Q9UNI6 340 aa20■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CROCCQ5TZA2 2017 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC162PA2VCL2 907 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 C16orf96A6NNT2 1141 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 UPK3BL1B0FP48 263 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 UPK3BL2E5RIL1 263 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 SLC7A4O43246 635 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 TIMP2P16035 220 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 LHCGRP22888 699 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ZP2Q05996 745 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 METTL21CQ5VZV1 264 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 DENND6AQ8IWF6 608 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 OR6P1Q8NGX9 317 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK15Q8TD08 544 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ARRDC3Q96B67 414 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 RCN3Q96D15 328 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 MFSD1Q9H3U5 465 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA8OA6NCC3 632 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA8NF8WBI6 632 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 H3BMQ9 156 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 STX7O15400 261 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 HSPA4LO95757 839 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GOT2P00505 430 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 C8BP07358 591 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 INHBBP09529 407 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CD72P21854 359 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ABCG1P45844 678 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 BMXP51813 675 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 INSCQ1MX18 579 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 DEPDC1Q5TB30 811 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GPR107Q5VW38 600 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC66Q68CR7 880 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF470Q6ECI4 717 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 NEPROQ6NW34 567 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 EPGNQ6UW88 154 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 DCLK2Q8N568 766 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 IL17RCQ8NAC3 791 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 HCAR2Q8TDS4 363 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 DHRS1Q96LJ7 313 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R36Q96LQ0 422 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 COG8Q96MW5 612 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 OR52B2Q96RD2 323 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CPNE1Q99829 537 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 CXorf21Q9HAI6 301 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ACSS2Q9NR19 701 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 GIN1Q9NXP7 522 aa19.99■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 A0A087WXM4 84 aa19.98■□□□□ 0.79
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms