RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TEAD4Q15561 434 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.96□□□□□ -1.3
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SMARCE1-201ENST00000264640 CES4AQ5XG92 561 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AFMIDQ63HM1 303 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HOMEZQ8IX15 550 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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SMARCE1-201ENST00000264640 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 EID2Q8N6I1 236 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA17Q96L03 361 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 GBP5Q96PP8 586 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC1Q99614 292 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ECSITQ9BQ95 431 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 APOL2Q9BQE5 337 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 BBS2Q9BXC9 721 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF358Q9NW07 568 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CREBBPQ92793 2442 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PQH9 124 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 E9PBE3 544 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL41O60662 606 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MAFKO60675 156 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PMPCBO75439 489 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AHSGP02765 367 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKCGP05129 697 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF1P05230 155 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-DPA1P20036 260 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGAXP20702 1163 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ME2P23368 584 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSL1P33121 698 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CTSKP43235 329 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DGKGP49619 791 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNA2D1P54289 1103 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NAGLUP54802 743 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UCNP55089 124 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MTTPP55157 894 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT3AP56704 352 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEP78395 509 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 IRF9Q00978 393 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 VAC14Q08AM6 782 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MED21Q13503 144 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SQLEQ14534 574 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC14A2Q15849 920 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PARP15Q460N3 678 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RANBP10Q6VN20 620 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NETO2Q8NC67 525 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AZIN2Q96A70 460 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OTUB2Q96DC9 234 aa6.95□□□□□ -1.3
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