RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 RAB39AQ14964 217 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RAET1EQ8TD07 263 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FANCEQ9HB96 536 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GID8Q9NWU2 228 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 WWOXQ9NZC7 414 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZNF711Q9Y462 761 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ANTXRLA6NF34 631 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 AREL1O15033 823 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PRKD3O94806 890 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GBAP04062 536 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SLC10A3P09131 477 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 UROSP10746 265 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CD70P32970 193 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 HNF1BP35680 557 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NFKB2Q00653 900 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 BEND5Q7L4P6 421 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GPR141Q7Z602 305 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ANKFN1Q8N957 763 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ROPN1LQ96C74 230 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LHX3Q9UBR4 397 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CFAP54Q96N23 3096 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 A0A0J9YVX5 310 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GSTA4O15217 222 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PRSS23O95084 383 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LDLRP01130 860 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PFKLP17858 780 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SUOXP51687 545 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CDH4P55283 916 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ERVK-8P63133 956 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 KLHL35Q6PF15 583 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 BBS5Q8N3I7 341 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GPR150Q8NGU9 434 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RHEBL1Q8TAI7 183 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ITFG1Q8TB96 612 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SCAMP4Q969E2 229 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CLPBQ9H078 707 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MAGEH1Q9H213 219 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CPQQ9Y646 472 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GNGT2O14610 69 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 EOMESO95936 686 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 BPIP17213 487 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 EPHA2P29317 976 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MAPKAPK2P49137 400 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 EMP3P54852 163 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MLLT10P55197 1068 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PRKG2Q13237 762 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ATP6AP1Q15904 470 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 SLC36A3Q495N2 470 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 XKR7Q5GH72 579 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 ADGRF1Q5T601 910 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 GPR26Q8NDV2 337 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS1-201ENST00000262460 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.51□□□□□ -1.05
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