RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239944.6

SERP1-201, Transcript of stress associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERP1, Length 3,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1-201ENST00000239944 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SERP1-201ENST00000239944 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SERP1-201ENST00000239944 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
SERP1-201ENST00000239944 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.63□□□□□ -0.07
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SERP1-201ENST00000239944 KRT87PA6NCN2 255 aa14.63□□□□□ -0.07
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