RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PROS1P07225 676 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MPSTP25325 297 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 FMO4P31512 558 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SLC1A2P43004 574 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A5Q01650 507 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CYP4F3Q08477 520 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MAP9Q49MG5 647 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 OTUD6BQ8N6M0 293 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PHC3Q8NDX5 983 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 KIF18AQ8NI77 898 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SEC14L1Q92503 715 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TMEM74Q96NL1 305 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 NRTNQ99748 197 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 GALPQ9UBC7 116 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 DKK4Q9UBT3 224 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MED16Q9Y2X0 877 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TAF4O00268 1085 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 DUX1O43812 170 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 UBXN7O94888 489 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MPOP05164 745 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-10P10266 1014 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 THRAP10827 490 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TYRP1P17643 537 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LSSP48449 732 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PDZD3Q86UT5 571 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 KCNMB4Q86W47 210 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 NCSTNQ92542 709 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 RSC1A1Q92681 617 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SATB2Q9UPW6 733 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 HAUS5O94927 633 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SLCO2B1O94956 709 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 GABRB3P28472 473 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SPNS2Q8IVW8 549 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CNTN4Q8IWV2 1026 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A15Q8IZD6 547 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CCDC74BQ96LY2 380 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 DPYSL5Q9BPU6 564 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LATS2Q9NRM7 1088 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 APC2O95996 2303 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CCDC187A0A096LP49 1063 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 NDC80O14777 642 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 NIPSNAP2O75323 286 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 C9P02748 559 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ESR1P03372 595 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TPBGLP0DKB5 382 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MAPK9P45984 424 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 GFERP55789 205 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MPP1Q00013 466 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CALCOCO2Q13137 446 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 RCBTB1Q8NDN9 531 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 FBXO25Q8TCJ0 367 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CALML6Q8TD86 181 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CERS2Q96G23 380 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CFAP36Q96G28 342 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 RAB17Q9H0T7 212 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 F8W8V4 182 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms