RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223129.8

RPA3-201, Transcript of replication protein A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPA3, Length 2,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3-201ENST00000223129 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 DHRS7Q9Y394 339 aa14.68□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 KPNA5O15131 536 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GCAP28676 217 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC19A1P41440 591 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 LIMK2P53671 638 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TAS2R39P59534 338 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RPA4Q13156 261 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ZNF460Q14592 562 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RPE65Q16518 533 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 C12orf66Q96MD2 445 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.67□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CPED1A4D0V7 1026 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC30A4O14863 429 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PPM1DO15297 605 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLCO2B1O94956 709 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 INHBAP08476 426 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ITGA2BP08514 1039 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 FDXRP22570 491 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 HALP42357 657 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 MSH2P43246 934 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 DAB2P98082 770 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ABRQ12979 859 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 BMPR2Q13873 1038 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TMED2Q15363 201 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 NR0B2Q15466 257 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 MROH9Q5TGP6 573 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CEP97Q8IW35 865 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PHC3Q8NDX5 983 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 MAPK15Q8TD08 544 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 INPP5DQ92835 1189 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GLMNQ92990 594 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GPR22Q99680 433 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PADI4Q9UM07 663 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 HMX2A2RU54 273 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CBX1P83916 185 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GUSBP11Q6P575 273 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.66□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 A0A0G2JNG1 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 OR5K4A6NMS3 321 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CKMT1AP12532 417 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 ACADLP28330 430 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 DMTNQ08495 405 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GBX1Q14549 363 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 KIR2DS5Q14953 304 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 MAP9Q49MG5 647 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 PDZD3Q86UT5 571 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 NFS1Q9Y697 457 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CEP250Q9BV73 2442 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 VIPP01282 170 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC2A4P14672 509 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CKMT2P17540 419 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CD9P21926 228 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 RPIAP49247 311 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms