RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Phf11A6H5X4 337 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klhl4B1AZR0 717 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atf6F6VAN0 656 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Snrnp40Q6PE01 358 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc39a14Q75N73 489 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gstm7Q80W21 218 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pdk1Q8BFP9 434 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klhl30Q8C3F7 581 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zdhhc1Q8R0N9 484 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mptx1Q8R1M8 219 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr531Q8VGL2 304 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 FignQ9ERZ6 759 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 NsdhlQ9R1J0 362 aa18.5■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp4a32A2A8T1 509 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm382B1AXN3 1250 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ifnar2O35664 513 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 RapsnP12672 412 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q149G0 166 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 MocosQ14CH1 862 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Defb33Q30KN3 62 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atxn7l3bQ3UD01 97 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrgprx2Q3UG50 352 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pld5Q3UNN8 536 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ube2fbQ3UWQ3 185 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q6P1I3 445 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ric8bQ80XE1 520 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rhot1Q8BG51 631 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bola2Q8BGS2 86 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcns3Q8BQZ8 491 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nlrp4aQ8BU40 982 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Grhl2Q8K5C0 625 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa18.49■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm42517A0A1Y7VLQ2 374 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kpna3O35344 521 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fpr-rs3O88537 343 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 RetP35546 1115 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pbx1P41778 430 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 InscQ3HNM7 579 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ripor1Q68FE6 1223 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Itln1bQ80ZA0 313 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp101Q8BP18 612 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc19Q8BZT5 364 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc34Q9DAM1 415 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ern1Q9EQY0 977 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 EmcnQ9R0H2 261 aa18.48■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 2410004P03RikA0A087WQY2 205 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbxl18E9PYR1 771 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Efna4O08542 206 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gna15P30678 374 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Polr2cP97760 275 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 ScinQ60604 715 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppp2r5eQ61151 467 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 St8sia1Q64687 355 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pgr15lQ80T54 456 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Actr5Q80US4 605 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pdlim2Q8R1G6 349 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cisd2Q9CQB5 135 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 P2yr13Q9D8I2 337 aa18.47■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1049A2ARZ0 308 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sec14l1A8Y5H7 715 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gnpda1O88958 289 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 PdgfrbP05622 1098 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 H2-T23P06339 357 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arntl2Q2VPD4 579 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il12rb1Q60837 738 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp4b1Q64462 511 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttc29Q80VM3 471 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ss18l1Q8BW22 402 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Crispld2Q8BZQ2 495 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scnm1Q8K136 229 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Serpina10Q8R121 448 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Det1Q9D0A0 550 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 RtcAQ9D7H3 366 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Thsd1Q9JM61 851 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Phc2Q9QWH1 850 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 ChmQ9QXG2 665 aa18.46■□□□□ 0.55
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zbed6D2EAC2 980 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Vmn2r99H3BK37 856 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dnmt3bO88509 859 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Got2P05202 430 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tas2r16P59529 299 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ano9P86044 747 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Osbp2Q5QNQ6 908 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lingo3Q6GQU6 589 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dyrk4Q8BI55 632 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc40Q8BI79 1192 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttc16Q8C1F5 767 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankra2Q99PE2 312 aa18.45■□□□□ 0.54
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tspan11Q9D1D1 253 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.5 ms