RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641944.1

CASC19-267, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,117 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-267	ENST00000641944	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944		H0YAE9	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MID1	O15344	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GLUD1	P00367	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GBA	P04062	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SLC9A3	P48764	834 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GLUD2	P49448	558 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	TRAF2	Q12933	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	CALCRL	Q16602	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	TANK	Q92844	425 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944		A0A087WV48	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944		A0A0U1RQK1	487 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	CLDN4	O14493	209 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	PTGES	O14684	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	STX6	O43752	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	KDM4B	O94953	1096 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	HOXC6	P09630	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	CYP11B2	P19099	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	CDC25C	P30307	473 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	NR4A2	P43354	598 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	PEX5	P50542	639 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	PGGT1B	P53609	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	C21orf58	P58505	322 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	TRAF3	Q13114	568 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	HLF	Q16534	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	CORO2A	Q92828	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	FZD8	Q9H461	694 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	DVL1	O14640	695 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	BMP10	O95393	424 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CASC19-267	ENST00000641944	TOMM40	O96008	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms