RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 OMDQ99983 421 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CDH22Q9UJ99 828 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IFT52Q9Y366 437 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SULT1C2O00338 296 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C2orf80Q0P641 193 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BMPR2Q13873 1038 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CCL15Q16663 113 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CA9Q16790 459 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BORCS7Q96B45 105 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0J9YYE9 177 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAM196BA6NMK8 535 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CENPBD1B2RD01 187 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OAZ2O95190 189 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CBX6O95503 412 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TPH1P17752 444 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LCN1P31025 176 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAGEA3P43357 314 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 AVPR1BP47901 424 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DCDC1P59894 354 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CRHR2Q13324 411 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PGAP1Q75T13 922 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LGI2Q8N0V4 545 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SIX5Q8N196 739 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF599Q96NL3 588 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GLI2P10070 1586 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 AP2A2O94973 939 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FOXO4P98177 505 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAMLD1Q13495 774 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LDLRAP1Q5SW96 308 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ASB9Q96DX5 294 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ABCC3O15438 1527 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 H0Y858 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KLF11O14901 512 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GSC2O15499 205 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CAP2P40123 477 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PTGER3P43115 390 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SMSP52788 366 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PPP3CAQ08209 521 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KCNC3Q14003 757 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MON1AQ86VX9 555 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 REPS2Q8NFH8 660 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NDC1Q9BTX1 674 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 USP29Q9HBJ7 922 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GSTM2P28161 218 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MED27Q6P2C8 311 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SNX15Q9NRS6 342 aa6.29□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 H0YAE9 185 aa6.28□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ACOX3O15254 700 aa6.28□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 AKAP3O75969 853 aa6.28□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BNIP1Q12981 228 aa6.28□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GPR33Q49SQ1 333 aa6.28□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.28□□□□□ -1.4
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