RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT9	Q9BW91	350 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ACSS2	Q9NR19	701 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	BTRC	Q9Y297	605 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC16A	O15027	2179 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNA1D	Q01668	2161 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338		A1L4Q6	167 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SGTA	O43765	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPN1	P07384	714 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	TNNT1	P13805	278 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	AKT1	P31749	480 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	RORA	P35398	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKN2B	P42772	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA1	P56199	1179 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC1A5	Q15758	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	TAZ	Q16635	292 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF567	Q8N184	647 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	IPMK	Q8NFU5	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	POMT2	Q9UKY4	750 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX7	Q9UNH6	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PCM1	Q15154	2024 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SYCE3	A1L190	88 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	MEN1	O00255	615 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM63A	O94886	807 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE1B	Q01064	536 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA9	Q13797	1035 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A19	Q695T7	634 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1L3	Q8NH93	324 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	LRFN5	Q96NI6	719 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC7	Q99615	494 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	HACD3	Q9P035	362 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	MGAT4D	A6NG13	374 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	CST8	O60676	142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	EPO	P01588	193 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	MSH3	P20585	1137 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP25	P42331	645 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	GSDMD	P57764	484 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	OLIG2	Q13516	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	RAPSN	Q13702	412 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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