RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	AMD1	P17707	334 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	UGT1A6	P19224	532 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	UGT1A1	P22309	533 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	UGT1A4	P22310	534 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ALG3	Q92685	438 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	SPATA13	Q96N96	652 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	CREG1	O75629	220 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	UBXN7	O94888	489 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	PSMB4	P28070	264 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ADRA1A	P35348	466 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	HAL	P42357	657 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	FOXM1	Q08050	763 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	AADACL2	Q6P093	401 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	GPR39	O43194	453 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	DPM1	O60762	260 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	CRTAM	O95727	393 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	CLDN1	O95832	211 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	BRAF	P15056	766 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	MSH3	P20585	1137 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	AKT1	P31749	480 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	PDE1B	Q01064	536 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	DMPK	Q09013	629 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM139	Q8IV31	216 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	PADI1	Q9ULC6	663 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PSME3-215	ENST00000592578	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	OR2AG2	A6NM03	316 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	LDLR	P01130	860 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	C9	P02748	559 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	RNF224	P0DH78	156 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	TYRP1	P17643	537 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	F8A1	P23610	371 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PSME3-215	ENST00000592578	CDC25B	P30305	580 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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